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第一届哲学社会科学奖（1986年1月）
一等奖：《新民主主义革命时期中国共产党在新疆斗争纪事》，自治区党委党史研究室
第二届哲学社会科学奖（1991年5月）
荣誉奖：《新疆和平解放》，自治区党委党史研究室
第三届哲学社会科学奖（1995年6月）
优秀论文二等奖：《毛泽东与新疆三区革命》，徐玉圻
著作荣誉奖：《中国共产党新疆历史大事记》，自治区党委党史研究室
鼓励奖：《中共新疆维吾尔自治区委员会组织史资料》，自治区党委党史研究室
第四届哲学社会科学奖（1999年6月）
荣誉奖：《新疆三区革命大事记》，新疆三区革命史编写组
优秀奖：《20世纪30年代共产国际苏联在新疆的活动》，自治区党委党史研究室
第五届哲学社会科学奖（2003年4月）
一等奖：《中共新疆地方史》（第一卷），自治区党委党史研究室；《新疆三区革命史》，自治区党委党史研究室
三等奖：《五十年代中国共产党处理少数民族宗教问题的方针与实践》，祁若雄
优秀奖：《实施西部大开发战略中民族因素的思考与对策》，刘江海
第六届哲学社会科学奖（2005年6月）
一等奖：《毛泽东民族理论研究》，主编：徐玉圻 高朝明
二等奖：《中国共产党是新疆各族人民利益的忠实代表》，自治区党委党史研究室
第七届哲学社会科学奖（2007年2月）
一等奖：《当代新疆简史》，自治区党委党史研究室
二等奖：《论毛泽东对我国少数民族地区发展问题的思考》，陈国裕 祁若雄
第八届哲学社会科学奖（2009年5月）
二等奖：《少数民族与抗日战争》，陈国裕 祁若雄
三等奖：《陈云在新疆的革命活动与影响》，祁若雄
优秀奖：《历史的辉煌——新疆实行民族区域自治50年》，自治区党委党史研究室
第九届哲学社会科学奖（2012年5月）
三等奖：《俞秀松在新疆的革命活动与贡献》，陈宇明 祁若雄
优秀奖：《对外开放政策在新疆的成功实践》，祁若雄
第十一届哲学社会科学奖（2016年12月）
优秀奖：《毛泽东治疆思想浅论》，孙新刚
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